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統合COVID-19検査:検出、変異株追跡、混合感染を一手順で

新しいタイプのCOVID-19検査戦略は、症例特定、変異株追跡、共感染ウイルス検出のプロセスを効率化する可能性があります。現在、これら3つの診断手順にはそれぞれ別々のアッセイと複雑なワークフローが関わり、通常は高度に専門化された施設で分析されます。研究者たちは今、これら3種類の検査を単一手順に統合し、COVID-19とSARS-CoV-2の多数の新興変異株のポイントオブケア追跡を可能にしました。

この検査は、ポータブルなアタッシュケースサイズのミニラボを用い、COVID-19スクリーニングとモニタリングの標準である遅く高価な技術を回避します。遺伝子手法(組換えポリメラーゼ増幅法と呼ばれる)とポータブルシーケンサーを活用し、ウイルス配列の存在を迅速に検出し、最大96患者検体を一度に読み取ります。

検査はSARS-CoV-2ゲノムの5セグメントをデコードするよう設計され、それぞれが変異株追跡の指針となるよう選ばれています。研究者たちはまた、COVID-19と類似症状を引き起こす3つの一般的な呼吸器ウイルスのアッセイも組み込みました。

チームは、SARS-CoV-2感染が疑われる人々の鼻咽頭スワブと、市下水から採取した廃水サンプルを用いて、この技術——NIRVANAと命名——を検証しました。これにより、SARS-CoV-2と他のウイルスの人口レベル監視が可能になることを示しました。

この検査の限界は、選択されたゲノム領域のSARS-CoV-2変異のみ検出可能なことです。世界中で新たな懸念変異株が次々と出現し続けているため、それらの領域はウイルスの進化を反映するよう更新が必要になるかもしれません。

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